組織特異的/疾患特異的にTreg細胞の作用を制御するため、患者由来の組織を用いて、免疫細胞集団のバルクRNA-seq、およびsingle cell RNA-seq分析を行い、Treg関連新規標的分子を探索するプラットフォームを構築している。

まず、患者と健常者の組織(血液ではないことがポイント)からRNA-seq, scRNA-seqを実施。scRNA-seqのデータ解析を行うときに、 Treg関連パスウェイを優先的に解析できるように、約1,000種類のTreg機能関連遺伝子を事前にキュレーションしており、その遺伝子群にフォーカスしてデータ解析を行う解析パイプラインを構築している。

組織特異的、疾患特異的に変動するTreg遺伝子から、Treg調節パスウェイに関する仮説構築(標的候補の同定)を行う。

加えて、in vitroで組織特異的Treg細胞の挙動を再現できるように、様々なTreg細胞活性化/抑制の刺激条件を特定しており、バリエーションに富むTreg細胞集団をin vitroで構築できる(Treg Atlas)。

標的候補の検証フェーズでは、対象疾患の患者由来のヒトプライマリーTreg細胞を用いて、アッセイを実施する。(おそらくTreg Atlasを用いて)複数の標的をハイスループットに検証するアッセイ系を構築していると思われる。アッセイの際にFunctional Fingerprintデータを蓄積し、更に詳細な検証試験に進める。

これまでに皮膚、腸、肺組織のTreg解析を行っており、Natureの記事では特定した約20種類の標的に作用する抗体分子を探索しているとのこと。

2021年の論文では、皮膚組織由来TregとCD4+ Teff細胞のRNA-seqデータの比較から、皮膚組織TregがC型レクチン様受容体のLAYN(layilin)を発現していることを発見。LAYNの発現はIn vitroでの免疫抑制誘導やTregの活性化にあまり影響を与えないが、Tregの皮膚組織のECMに接着させ皮膚組織に蓄積する機能を果たすことを特定している。

また、2023年にはIL-1R2抗体を特許申請しており、腫瘍組織に存在するTreg細胞がIL-1R2を発現することから(Table 3)、IL-1R2抗体の投与によって腫瘍組織のIL-1R2+ Tregを阻害し免疫抑制状態を解除するアプローチが説明されている。