特定のmiRNA分子によって発現制御を受けるmiRNA結合配列を、mRNA医薬品、もしくはウイルスベクターの5'-UTR、もしくは3'-UTRコード部分に搭載する発現制御技術。

組織特異的、もしくは細胞タイプ特異的なmiRNA分子を探索し、そのmiRNAが結合する配列を用いることで標的組織/標的細胞特異的な発現制御を行う。発現を抑制するRNAスイッチと、発現を促進するRNAスイッチの両方に対応している。

miRNAはヒトで同定されている2,650種全てのmiRNA結合配列を特定済みであるとのこと。

2023年のセミナー動画では、
・中枢神経系疾患(mRNA or AAV)
・眼科(mRNA)
・全身性投与時の心臓・肝臓発現回避(AAV or mRNA)
のプログラムについて提携企業との研究開発を進めており、in-houseのプログラムとして肺動脈性肺高血圧症(PAH)、変形性関節症(OA)の研究を進めていることを紹介している(動画4:15頃〜)。

また、RNA switch技術は京都大学(CiRA)/東京大学の齊藤博英先生のラボの研究成果に基づいており、齊藤先生は2023年の論文で、環状化RNA(circRNA)にmIRNA結合配列を配置し、miRNAの存在下でcircRNAの発現をOFFにするcircRNA switchの技術を報告している。

加えて、2025年の論文では、単一のRNA switchでON, OFF制御を行うと、目的細胞でのみ発現する特異性の高いmiRNAが見つかりづらい問題と、OFF状態であっても多少の発現が起こってしまうleaky expressionの問題があるため、よりON/OFFシグナル比を高めたSplit RNA switchシステムを報告している。

発現させたいタンパク質をONコンストラクト、OFFコンストラクトの2種に分割(split)してコードしたことに特徴があり、それぞれの分割タンパク質に融合する形でinteinをコードさせておく。
ONコンストラクトはON制御, OFFコンストラクトはOFF制御をそれぞれ受けて、AND条件で2種のsplitタンパク質の発現が成功すれば、inteinを介した翻訳後のタンパク質スプライシングによって全長タンパク質が産生され、機能する仕組み(Fig.1)。
論文では、抗生物質耐性遺伝子やアポトーシス誘導遺伝子などの発現をこのシステムで制御し、細胞種選択的な発現制御の概念実証を行っている。また、Cas9をsplitしてコードすることで、細胞種選択的に遺伝子編集活性を示すことを確認している(Fig.5)。

今後はこれらの技術がaceRNA社で使用される可能性がある。