Celsius Therapeutics

Broad Instituteのスピンオフ企業。複数の大学、医療機関と提携し、がんや自己免疫疾患患者のサンプルにアクセスしscRNA-seq測定を実施。データ解析パイプラインを自社で構築し、短時間でのデータ解析、および複数回の測定データの統合解析を可能にしており、同一患者の治療前後の測定など数千サンプルの測定データを蓄積し、新規標的を探索する。抗TNF抗体治療耐性IBD患者の分析から抗TREM-1抗体プログラムを推進し、現在Phase 1段階にある。2024年にAbbvie社が買収することを発表している。

CytoReason

バルクのRNA-seq実験データに対して、自社で蓄積したCyTOFやscRNA-seqなどのシングルセル・オミックスデータや文献情報に基づき構築したimmune cell model / cell interaction modelを用いて、遺伝子発現を特定の細胞集団ごとに紐付ける細胞deconvoluation技術を持つ。免疫領域に特化して細胞タイプごとの関連因子を整理したことで、疾患メカニズムの解明や標的探索、バイオマーカー探索に活用できる。Pfizer, Roche, Sanofi, Ferring Pharmaなど大手製薬企業との提携が多く、PfizerとFerring Pharmaとは新規標的探索の研究を含む提携であることを発表している。

Immunai

独自のシングルセルマルチオミックスの分析技術を持つ企業。TCR/BCRクロノタイプと遺伝子発現、表面マーカー発現、sgRNAを同時に検出するCITE-seqの改良版技術(ECCITE-seq)や、腫瘍表面抗原の発現とscATAC-seq, mtDNAシーケンスを統合した技術(ASAP-seq)を報告している。これらのシングルセルマルチオミックスのデータをscRNA-seq解析データパイプラインを基盤とする機械学習により分析し、腫瘍免疫領域で新規の標的を探索している。異なる試験バッチのデータを統合的に分析できるように、転移学習ベースの機械学習にも取り組んでいる。設立数年で約$300Mの巨額の資金調達を行い、バイオインフォマティクス関連の企業(Dropprint Genomics, Nebion)を買収している。

Memo Therapeutics

患者由来のメモリーB細胞集団から、重鎖と軽鎖のペアリングを保持した抗体ライブラリを調製し、哺乳類細胞のdisplay screeningによって抗体を探索する技術を持つ企業。マイクロ流路ベースのシングルセル単離によって重鎖/軽鎖ペアリングライブラリを構築し、膜結合型全長IgGとしてHEK 293細胞に発現させている。マイクロ流路ドロップレットソーターを自社で開発し、細胞結合アッセイやADCCアッセイなど、display screening時にfunctional assayを行うことができる。抗体探索は免疫動物(ウサギ)を用いることも可能。腎移植時のBKポリオーマウイルス(BKV)感染を対象とした中和抗体の品目(MTX-005)がPhase 1段階にある。小野薬品工業と、腫瘍免疫領域の抗体探索を目的に提携している。

Cellarity

single cell RNA-seq(scRNA-seq)の機械学習データ分析により、新規標的を探索する技術を持つ。報告されている論文事例やインタビュー記事から推察して、scRNA-seqのデータ解析時に大枠でセルタイプグループを分類し、その後それぞれのグループで詳細なセルタイプを分析する段階的なクラスタリングを行う。それらの詳細なセルタイプに対してtrajectory analysisを行い、Disease cell⇔Healthy cellの遺伝子発現の変化を段階的な変化として捉え、疾患ドライバー因子とその間接的な影響を受ける下流の因子とを区別し、標的候補を特定する。血液疾患, 腫瘍免疫, 代謝性疾患, 呼吸器系疾患領域で自社創薬を行っており、リード品の鎌状赤血球症を対象とした品目がリード最適化段階にある。Novo NordiskとNASHを対象とした共同研究を行っている。